From 1993 to 1994 Illarionov was the head of the Analysis and Planning Group of the Chairman of the Council of Ministers and the Government of Russia, Viktor Chernomyrdin, after which he went on to become the vice-president of the Leontyev International Social and Economic Research Centre, and director of the Moscow division.
Vuosina 1993–1994 Illarionov johti ministerineuvoston ja hallituksen puheenjohtaja Viktor Tšernomyrdinin analyysi- ja suunnittelutyöryhmää, minkä jälkeen hänestä tuli Leontievin kansainvälisen sosiaali- ja taloustieteiden tutkimuskeskuksen varajohtaja ja Moskovan yksikön päällikkö.