In 1993, Samtredia became one of the major battlegrounds in the Georgian Civil War in which the forces loyal to the ousted President Gamsakhurdia confronted the post-coup government troops, and briefly controlled the town from October 17 to October 23, 1993, putting all communications to Tbilisi under threat.
Myöhemmin vuonna 1993 Samtredia joutui yhdeksi Georgian sisällissodan keskeisimmistä taistelukentistä, jossa syrjäytetylle presidentti Gamsakhurdialle uskolliset joukot ottivat yhteen vallankaappauksen jälkeistä hallitusta kannattavien joukkojen kanssa ja pitivät lyhyen aikaa kaupunkia hallussaan 17.–23. lokakuuta 1993 uhaten kaikkia yhteyksiä Tbilisiin.