Isaksson was a research assistant on Antarctic projects at Stockholm University (1988–1995), before becoming a glaciologist at the Norwegian Polar Institute in February 1995, a position she maintains today as head of the Geology and Geophysics department.
Isaksson var forskarassistent på Antarktisprojekt vid Stockholms universitet (1988-1995), innan hon blev glaciolog vid Polska Institutet i februari 1995, en position som hon för närvarande håller till som chef för geologi och geofysikavdelningen.