According to a cladistic study by Phil Senter in 2004, Longisquama would be an even more basal diapsid and a member of Avicephala, more closely related to Coelurosauravus.
Enligt en studie inom kladistik av Phil Senter 2004 borde Longisquama vara en än mer basal diapsid, och en medlem av Avicephala, mer närbesläktad med Coelurosauravus.