Though noting that the visuals and presentation of the game would be the first thing that players noticed, Nathan Cocks of PC PowerPlay claimed that "from a design standpoint, Aquaria is a triumph," with the right amount of complexity and level design that is "spot on".
Trots att ha noterat att spelets grafik och presentation skulle vara det första som spelare skulle lägga märke till, skrev Nathan Cocks på PC Powerplay att "från ett designperspektiv, är Aquaria en triumf," med den rätta mängden komplexitet och nivådesign som är "på pricken".