The quality of some of the editing has been challenged in subsequent decades, with one writer calling the Händel-Gesellschaft edition "anything but complete and reliable" and another criticizing Chrysander's "arbitrary selection of material in the more complex works and his failure to explain his methods."
Kvaliteten på en del av utgåvorna har under senare decennier ifrågasatts och en skribent kallar det "allt utom fullständigt och pålitligt" och en annan kritiserar Chrysanders "godtyckliga urval av material till de mer komplexa verken och hans oförmåga att förklara sina metoder".